TCC - Bacharelado em Ciências Biológicas (Sede)
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Item Diversidade das aquaporinas no genoma de Culex quinquefasciatus: um estudo in silico(2023-09-19) Xavier, Italo Gois; Oliveira, Iêda Ferreira de; http://lattes.cnpq.br/5288071226008713; http://lattes.cnpq.br/3953245363870196Culex quinquefasciatus é uma espécie cosmopolita transmissora do nematóide Wuchereria bancrofti, agente etiológico da filariose linfática. Ao longo do seu ciclo de vida, esse mosquito necessita sobreviver a condições ambientais adversas e a diversos estressores biológicos. Nesse processo, mecanismos moleculares são essenciais para o restabelecimento da homeostase do organismo e as aquaporinas são um grupo de biomoléculas potencialmente importantes nessas respostas. As aquaporinas são uma superfamília de proteínas formadoras de canais transmembranares, altamente hidrofóbicas, que estão presentes em todos os organismos vivos, responsáveis primariamente pelo transporte facilitado de água. O objetivo deste trabalho foi identificar, classificar e caracterizar as aquaporinas presentes no genoma do mosquito Culex quinquefasciatus por ferramentas in silico. Para isso, foram feitas análises comparativas estruturais e funcionais das sequências gênicas e protéicas das aquaporinas identificadas no banco de dados NCBI, usando informações genômicas das espécies Drosophila melanogaster, Anopheles gambiae e Aedes aegypti. Seis prováveis genes e 15 isoformas foram identificados no genoma de Culex quinquefasciatus, todos localizados no cromossomo 2, e classificados nas subfamílias DRIP, BIB, PRIP, Eglp1 e Eglp3. Todas as sequências proteicas foram confirmadas para a topologia, arquitetura, localização subcelular e outros parâmetros físico-químicos característicos das aquaporinas. Os motivos e estrutura gênica das aquaporinas de Culex quinquefasciatus mostraram-se conservados dentro de uma mesma família, mas sutilmente diferentes entre os membros de diferentes famílias, refletindo suas diferentes funções biológicas. Os resultados provenientes destas análises poderão ajudar a conhecer melhor os aspectos moleculares dessas proteínas de transporte transmembrana, que são de grande importância para a biologia e evolução dessa espécie de importância médico-veterinária.Item Análise de colinearidade gênica do operon aprX-lipA em isolados de Pseudomonas fluorescens(2023-09-15) Silva, Israel Santos da; Freitas, Nara Suzy Aguiar de; Souza, Paulo Roberto Eleutério de; http://lattes.cnpq.br/1971832245117283; http://lattes.cnpq.br/6891650997818766; http://lattes.cnpq.br/9803828236017805Pseudomonas fluorescens são bacilos gram-negativos que possuem motilidade e estão presentes em ecossistemas terrestres e aquáticos. Por possuírem característica psicrotrófica, essas bactérias estão frequentemente relacionadas à contaminação de leite não pasteurizado e seus derivados, como queijo e manteiga. As proteases e lipases produzidas por P. fluorescens são o principal fator na prevalência de contaminação de produtos lácteos. Essas enzimas são codificadas pelos genes aprX e lipA, presentes no operon aprX-lipA. Nesse sentido, avaliamos os componentes genômicos circunvizinhos ao operon aprX-lipA de P. fluorescens de diferentes origens, visando detectar padrões genéticos inerentes a esses organismos e sua correlação com a atividade proteolítica. Utilizamos o banco de dados do NCBI, a plataforma String e Interpro para avaliação comparativa dos genomas selecionados. Nos quatro isolados analisados o operon aprX-lipA é altamente variado, estruturalmente, com configurações exclusivas para cada genoma. As relações de co-expressão gênica dos genes circunvizinhos à protease aprX, também, apresentam variações qualitativas e quantitativas, intra e inter-espécies do gênero Pseudomonas. Detectamos os componentes do sistema CRISPR tipo 1, até então não relacionado com o operon, que podem amplificar, movimentar e modificar genes relacionados com o mecanismo de defesa, patogênico ou não, do gênero. Os padrões relacionados à patogenicidade indicam que novos biomarcadores podem ser utilizados pela vigilância genômica.Item Perfis genômicos do transposon Tn4401 de isolados de Proteus sp., Providencia sp. e Morganella sp(2022-07-03) Silva, Larissa Almeida da; Freitas, Nara Suzy Aguiar de; Santos, Dayane da Silva; http://lattes.cnpq.br/0456504242112576; http://lattes.cnpq.br/6891650997818766A resistência aos antibióticos é uma ameaça global crescente à saúde pública, causando alta mortalidade. Mutação deriva genética, transferência horizontal de genes via transposons e seleção natural são os mecanismos básicos responsáveis pela disseminação de genes de resistência entre populações bacterianas. A tribo Proteeae é composta por três gêneros: Proteus spp., Morganella spp. e Providencia spp., bactérias patogênicas oportunistas e resistentes a [beta]-lactâmicos. O transposon altamente móvel Tn4401 de Klebsiella pneumoniae e Escherichia coli é caracterizado por conter genes blaKPC que codificam β-lactamase, garantindo resistência aos [beta]-lactâmicos. O objetivo foi analisar a história evolutiva dos genomas da tribo Proteeae e seus transposons Tn4401, mediante padrões, variações e sintenias das sequências dos genomas e de suas regiões vizinhas. Inicialmente, as sequências de Tn4401 de K. pneumoniae (Kp15, Kp512, Kp529-1) foram utilizadas como sequência query no BLASTn/NCBI para busca de cepas da tribo Proteeae. Em seguida, os arquivos GenBank selecionados foram utilizados no software Islandviewer 4.0 para análise de similaridade e sintenia e as sequências FASTAS foram incorporadas ao ClustalW/MEGA 11. Após o alinhamento, foi estabelecida a razão de substituições não-sinônimas por sinônimas. Diferentes isoformas de Tn4401 foram reveladas, entre elas, Tn4401a, Tn4401b e Tn4401d contendo blaKPC. Vários padrões de sítios gênicos do transposon foram detectados, envolvendo deleções, inversões, duplicações e mobilidade de grupos gênicos vizinhos, ora semelhantes, ora diferentes. A seleção purificadora foi uma força ativa nas [beta]-lactamases das cepas analisadas. Foi detectado uma possível relação entre as isoformas do transposon e ilhas vizinhas de resistência a Mercúrio, Cromato e Sulfonamida. Esses achados enfatizam a ação contínua de diferentes processos evolutivos nos plasmídeos e no elemento Tn4401, bem como o possível potencial de disseminação de genes de resistência pela tribo Proteeae.