Navegando por Assunto "Marcadores genéticos"

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Desenvolvimento e validação de marcadores moleculares tipo microssatélites a partir do transcriptoma de Vigna unguiculata (L.) Walp.
(2019-07-17) Oliveira, Wilson Dias de; Iseppon, Ana Maria Benko; Araújo, Flávia Czekalski de; http://lattes.cnpq.br/1888011932745430; http://lattes.cnpq.br/7796654028353519; http://lattes.cnpq.br/3544882037972617
O melhoramento genético de plantas tem potencializado ganhos contínuos na produtividade de diversas culturas. Neste contexto, marcadores moleculares se destacam como uma ferramenta promissora, que possibilita o acesso direto ao genótipo do indivíduo, diferenciando-se, assim, dos marcadores morfológicos. Os microssatélites (SSR), são marcadores codominantes e figuram entre os mais utilizados para esta finalidade. Assim, o presente trabalho objetivou desenvolver e validar marcadores SSR para uso em programas de melhoramento genético do feijão-caupi [Vigna unguiculata (L.) Walp.]. Para isso, foram analisados três transcriptomas da espécie, oriundos de experimentos por infecção pelo CPSMV (Cowpea Severe Mosaic Virus), CABMV (Cowpea Aphid-born Mosaic Virus) e desidratação radicular. Um pipeline computacional foi usado para identificação e anotação dos SSRs. A seleção dos candidatos para o desenvolvimento dos marcadores foi realizada considerando o polimorfismo de tamanho entre os motivos, seguindo para o desenho dos primers utilizando a ferramenta SnapGene. Foram identificadas 45.776 sequências contendo SSRs, dentre os quais prevaleceram os motivos di- e trinucleotídeos, representando conjuntamente um total de 60% das sequências identificadas. Destas, 3.493 sequências estiveram presentes nos três transcriptomas analisados, onde 160 foram selecionadas com base na diferença de tamanho mais significativa (12-42) entre os motivos, seguindo para o desenho de 30 marcadores SSRs. Na etapa de PCR convencional, foi observado que 73% dos marcadores confirmaram polimorfismo entre os acessos BR 14-Mulato e IT85F-2687, enquanto que 57% foram polimórficos entre Pingo de Ouro e Santo Inácio. Um total de 23 marcadores foram transferíveis para a V. unguiculata subsp. sesquipedalis e 16 para V. radiata (L.). Por fim, a análise permitiu a identificação dos SSRs nos transcriptomas do feijão-caupi, submetido a estresses bióticos e abióticos, revelando polimorfismos entre diferentes acessos. Os dados identificados, analisados e validados irão contribuir com estudos de diversidade genética e pré-melhoramento, visando ampliar a base genética disponível do feijão-caupi.
Estudo do polimorfismo +874 T/A do gene interferon gamma em pacientes com artrite reumatoide do estado de Pernambuco
(2018) Barboza, Daniella Alves Silva Pimentel; Maia, Maria de Mascena Diniz; Silva, Isaura Isabelle Fonseca Gomes da; http://lattes.cnpq.br/9915138553762710; http://lattes.cnpq.br/7051998554981575
Artrite Reumatoide (AR) é uma doença autoimune com prevalência entre 0.5% a 1% da população mundial adulta. A etiologia ainda não está completamente esclarecida, porém é sabido que fatores hormonais, ambientais e imunológicos atuam conjuntamente em indivíduos com predisposição genética. Dentre os fatores genéticos o polimorfismo +874 T/A do gene Interferon gamma (IFNG) é citado como atuante em diversas doenças autoimunes. Neste sentido, o objetivo deste trabalho é analisar a relação do polimorfismo +874 T/A do gene IFNG na AR, em uma população do Estado de Pernambuco. A presente pesquisa foi composta por 127 pacientes e 127 controles saudáveis, dos quais as amostras de sangue coletadas foram utilizadas para extração do DNA. Posteriormente, foi realizada a amplificação do DNA extraído, através da Reação em cadeia da polimerase alelo específica (PCR-AS). O material amplificado foi submetido à eletroforese em gel de agarose a 2%. Os cálculos estatísticos foram realizados utilizando o teste Qui-quadrado e Análise de Variância. Os resultados apresentados indicaram que o polimorfismo + 874 T/A do gene IFNG não está associado ao desenvolvimento da AR, com distribuição genotípica (TA x AA:p = 0.530 e TT x AA: p = 0.416) e frequência alélica (p = 0.851). Entretanto, os indivíduos com genótipos TT e TA apresentaram índices de atividade da doença significativamente mais elevados em comparação com os portadores do genótipo AA (DAS28: p=0.017; CDAI: p=0.021). Sugerindo que o polimorfismo +874 T/A do gene IFNG pode ser considerado como um marcador para atividade da doença AR.
Seleção de primers ISSR para estudo da diversidade genética da espécie Myrciaria floribunda O. Berg
(2018) Silva, Allison Vieira da; Silva, Edson Ferreira da; http://lattes.cnpq.br/7596200308340209; http://lattes.cnpq.br/6702679911102412
A espécie Myrciaria floridunda O. Berg, conhecida popularmente como cambuí, pertence à família das Myrtaceaes. O cambuí é uma espécie nativa, não endêmica que ocorre em diver- sificados ambientes na Amética Central e na América do Sul. São plantas de crescimento lento, com hábito arbustivo ou subarbustivo. Os frutos, produto de interesse da espécie, são do tipo baga, pequenos, esféricos com coloração laranja, vermelha e vinho quando estão maduros. A exploração da espécie ainda é majoritariamente extrativista, realizada por famílias tradicio- nais locais que em época de frutificação da espécie alavancam a renda com venda dos frutos em feiras. Os frutos podem ser consumidos em natura, em forma de geleias, licor ou vinho. Para estudo da diversidade genética da espécie com utilização de marcadores moleculares do tipo ISSR, é necessário que primeiramente seja isolado DNA em qualidade e quantidade sufi- cientes para desenvolvimento do trabalho. A coleta do material foi realizada no banco de ger- moplasma ativo da Universidade Federal de Alagoas, foram coletadas folhas como amostras. O DNA da espécie foi extraído a partir da metodologia do detergente CTAB com modificação de adaptação à espécie. Com o DNA isolado, foram testados doze primers ISSR em dois genó- tipos de cambuí. Dos doze primers, oito foram selecionados por apresentarem índice de poli- morfismo acima de 50%, são eles: UFAL-2, UFAL-3, UFAL-5, UFAL-6, UFAL-7, UFAL-8, UFAL-9 e UFAL-10.